DNA 拓扑异构酶 I 和 II 是核酶，II 型包括两个高度同源的同工型：拓扑异构酶 IIα 和 IIβ。这些酶可调节 DNA 拓扑结构，维持基因组完整性，并且对 DNA 复制、重组、转录以及通过允许 DNA 链通过彼此的染色体分离等过程非常重要 (1)。拓扑异构酶 I 切断并重新接合双螺旋 DNA 中的一条链，而拓扑异构酶 II 能够使DNA的双链瞬时断裂并使双链断端再连接(2)。拓扑异构酶对各种应激非常敏感。酸性 pH 值或氧化应激会使拓扑异构酶转化为 DNA 断裂核酸酶，导致基因组不稳定性和细胞死亡。DNA 损伤的拓扑异构酶靶向药物（如 etoposide）还会将拓扑异构酶转化为核酸酶，这种酶通常被诱捕为一个中间物，能共价结合剪切后的 DNA 链的 5+ 末端。研究表明，这种中间物会导致基因组不稳定性和细胞死亡。因此，以拓扑异构酶为靶点成为癌症化疗药物开发的重要方向 (3)。Ca²⁺ 调节的拓扑异构酶 IIα Ser1106 磷酸化能调节这种酶的活性及其对靶向药物的敏感性 (4)。
酪蛋白激酶 2 (CK2) 磷酸化 DNA 拓扑异构酶 IIα Ser1469，从而产生一个能够被有丝分裂特异性抗体 MPM-2 识别的位点 (5)。